mod_rewriteを使っているサイトでクエリーを受け取ろうと思った時に、複雑な条件がいるのかと色々調べてたらかなりシンプルにできることが判明。最期に[QSA]を付ければいいだけだった。

例：RewriteRule ^(.*)/$ index.php?$1 [QSA]